MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013205	GGC	2	6	303518	303523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510286
6002	NC_013205	AAC	2	6	303584	303589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510286
6003	NC_013205	TTGGT	2	10	303606	303615	0 %	60 %	40 %	0 %	258510286
6004	NC_013205	ACG	2	6	303620	303625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510286
6005	NC_013205	GTCG	2	8	303673	303680	0 %	25 %	50 %	25 %	258510286
6006	NC_013205	GGT	2	6	303706	303711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510286
6007	NC_013205	CCAA	2	8	303780	303787	50 %	0 %	0 %	50 %	258510286
6008	NC_013205	AGC	2	6	303833	303838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510286
6009	NC_013205	ACG	2	6	303845	303850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510286
6010	NC_013205	GGT	2	6	303872	303877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510286
6011	NC_013205	TGC	2	6	303970	303975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510286
6012	NC_013205	CGC	2	6	304032	304037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510286
6013	NC_013205	GGTC	2	8	304041	304048	0 %	25 %	50 %	25 %	258510286
6014	NC_013205	TCG	2	6	304098	304103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510286
6015	NC_013205	GCG	2	6	304137	304142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510286
6016	NC_013205	TA	3	6	304161	304166	50 %	50 %	0 %	0 %	258510286
6017	NC_013205	TTC	2	6	304202	304207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510286
6018	NC_013205	CGA	2	6	304209	304214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510286
6019	NC_013205	ACA	2	6	304260	304265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510286
6020	NC_013205	ACT	2	6	304379	304384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510286
6021	NC_013205	GAC	2	6	304387	304392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510286
6022	NC_013205	TCCGT	2	10	304466	304475	0 %	40 %	20 %	40 %	258510286
6023	NC_013205	CTC	2	6	304519	304524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510286
6024	NC_013205	GTC	2	6	304526	304531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510286
6025	NC_013205	ACG	2	6	304590	304595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510286
6026	NC_013205	CAC	2	6	304627	304632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510286
6027	NC_013205	CAA	2	6	304636	304641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510286
6028	NC_013205	AAC	2	6	304769	304774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510286
6029	NC_013205	AAC	3	9	304778	304786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510286
6030	NC_013205	TGGC	2	8	304926	304933	0 %	25 %	50 %	25 %	258510286
6031	NC_013205	TGG	2	6	304998	305003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510286
6032	NC_013205	ACA	2	6	305052	305057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510286
6033	NC_013205	AAC	2	6	305063	305068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510286
6034	NC_013205	ACG	2	6	305093	305098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510286
6035	NC_013205	TACGTG	2	12	305174	305185	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258510286
6036	NC_013205	CTT	2	6	305196	305201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510286
6037	NC_013205	TAC	2	6	305285	305290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510286
6038	NC_013205	ACG	2	6	305345	305350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510286
6039	NC_013205	TCTCGG	2	12	305416	305427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510286
6040	NC_013205	ACA	2	6	305433	305438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510286
6041	NC_013205	CAG	2	6	306515	306520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510287
6042	NC_013205	TGA	2	6	306576	306581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510287
6043	NC_013205	CTG	2	6	306587	306592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510287
6044	NC_013205	GTTG	2	8	306671	306678	0 %	50 %	50 %	0 %	258510287
6045	NC_013205	GCGA	2	8	306709	306716	25 %	0 %	50 %	25 %	258510287
6046	NC_013205	CTG	2	6	306764	306769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510287
6047	NC_013205	TTG	2	6	306773	306778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510287
6048	NC_013205	GAT	2	6	306788	306793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510287
6049	NC_013205	GAG	2	6	307053	307058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510288
6050	NC_013205	CTT	2	6	307086	307091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510288
6051	NC_013205	TGGC	2	8	307120	307127	0 %	25 %	50 %	25 %	258510288
6052	NC_013205	AAT	2	6	307226	307231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258510288
6053	NC_013205	ACACT	2	10	307247	307256	40 %	20 %	0 %	40 %	258510288
6054	NC_013205	GGT	2	6	307285	307290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510288
6055	NC_013205	ATG	2	6	307295	307300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510288
6056	NC_013205	AAC	2	6	307350	307355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510288
6057	NC_013205	CGC	2	6	307374	307379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510288
6058	NC_013205	GCA	2	6	307540	307545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510288
6059	NC_013205	CTG	2	6	307566	307571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510288
6060	NC_013205	GCA	2	6	307594	307599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510288
6061	NC_013205	CGG	2	6	307611	307616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510288
6062	NC_013205	GGC	2	6	307644	307649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510288
6063	NC_013205	GCGTAG	2	12	307678	307689	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258510288
6064	NC_013205	CGT	2	6	307745	307750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510288
6065	NC_013205	GCA	2	6	307795	307800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510288
6066	NC_013205	CCA	2	6	307831	307836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510288
6067	NC_013205	GAA	2	6	307890	307895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510288
6068	NC_013205	AAG	2	6	307912	307917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510288
6069	NC_013205	CAA	2	6	308085	308090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510288
6070	NC_013205	GAAT	2	8	308103	308110	50 %	25 %	25 %	0 %	258510288
6071	NC_013205	GTA	2	6	308124	308129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510288
6072	NC_013205	CGAG	2	8	308197	308204	25 %	0 %	50 %	25 %	258510288
6073	NC_013205	AAAT	2	8	308228	308235	75 %	25 %	0 %	0 %	258510288
6074	NC_013205	GCTGA	2	10	308247	308256	20 %	20 %	40 %	20 %	258510288
6075	NC_013205	GCCA	2	8	308319	308326	25 %	0 %	25 %	50 %	258510288
6076	NC_013205	CAG	2	6	308343	308348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510288
6077	NC_013205	GCCT	2	8	308381	308388	0 %	25 %	25 %	50 %	258510288
6078	NC_013205	CAC	2	6	308398	308403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510288
6079	NC_013205	AGC	2	6	308415	308420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510288
6080	NC_013205	ATG	2	6	308469	308474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510288
6081	NC_013205	CGC	2	6	308510	308515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510288
6082	NC_013205	GCAACA	2	12	308518	308529	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	258510288
6083	NC_013205	CTC	2	6	308534	308539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510288
6084	NC_013205	AAG	2	6	308542	308547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510288
6085	NC_013205	GC	3	6	308553	308558	0 %	0 %	50 %	50 %	258510288
6086	NC_013205	GAG	2	6	308601	308606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510288
6087	NC_013205	C	6	6	308633	308638	0 %	0 %	0 %	100 %	258510288
6088	NC_013205	GAG	2	6	308652	308657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510288
6089	NC_013205	CA	3	6	308701	308706	50 %	0 %	0 %	50 %	258510288
6090	NC_013205	GCA	2	6	308758	308763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510288
6091	NC_013205	CCAT	2	8	308859	308866	25 %	25 %	0 %	50 %	258510288
6092	NC_013205	A	6	6	308964	308969	100 %	0 %	0 %	0 %	258510288
6093	NC_013205	CAG	2	6	309023	309028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510288
6094	NC_013205	AGA	2	6	309032	309037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510288
6095	NC_013205	GA	3	6	309036	309041	50 %	0 %	50 %	0 %	258510288
6096	NC_013205	AGCGC	2	10	309133	309142	20 %	0 %	40 %	40 %	258510288
6097	NC_013205	GGC	2	6	309153	309158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510288
6098	NC_013205	AGC	2	6	309163	309168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510288
6099	NC_013205	GAA	2	6	309204	309209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510288
6100	NC_013205	AAG	2	6	309223	309228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510288
6101	NC_013205	ACG	2	6	309301	309306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510288
6102	NC_013205	TCG	3	9	309554	309562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510289
6103	NC_013205	TGG	2	6	309580	309585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510289
6104	NC_013205	CTC	2	6	309631	309636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510289
6105	NC_013205	TAT	2	6	309637	309642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510289
6106	NC_013205	GC	3	6	309714	309719	0 %	0 %	50 %	50 %	258510289
6107	NC_013205	TGG	2	6	309866	309871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510289
6108	NC_013205	TCG	2	6	309881	309886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510289
6109	NC_013205	TGC	2	6	309896	309901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510289
6110	NC_013205	GCC	2	6	309911	309916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510289
6111	NC_013205	TGA	2	6	310041	310046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510289
6112	NC_013205	CG	4	8	310052	310059	0 %	0 %	50 %	50 %	258510289
6113	NC_013205	GAC	2	6	310084	310089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510289
6114	NC_013205	GAG	2	6	310105	310110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510289
6115	NC_013205	TCG	2	6	310115	310120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510289
6116	NC_013205	GGT	2	6	310125	310130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510289
6117	NC_013205	GC	3	6	310329	310334	0 %	0 %	50 %	50 %	258510289
6118	NC_013205	CGC	2	6	310376	310381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510289
6119	NC_013205	TGG	2	6	310385	310390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510289
6120	NC_013205	ATTGCG	2	12	310393	310404	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258510289
6121	NC_013205	TCG	2	6	310414	310419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510289
6122	NC_013205	CGG	2	6	310588	310593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510289
6123	NC_013205	TCG	2	6	310706	310711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510289
6124	NC_013205	ATGG	2	8	310790	310797	25 %	25 %	50 %	0 %	258510289
6125	NC_013205	TG	3	6	310881	310886	0 %	50 %	50 %	0 %	258510289
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6129	NC_013205	TCG	2	6	311061	311066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510290
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6131	NC_013205	GAT	2	6	311314	311319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510290
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6133	NC_013205	CG	3	6	311362	311367	0 %	0 %	50 %	50 %	258510290
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6135	NC_013205	GTC	2	6	311414	311419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510290
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6142	NC_013205	GCC	2	6	311803	311808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510290
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6151	NC_013205	TTTG	2	8	312123	312130	0 %	75 %	25 %	0 %	258510291
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6239	NC_013205	GAAG	2	8	318191	318198	50 %	0 %	50 %	0 %	258510295
6240	NC_013205	CGC	2	6	318404	318409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510295
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6242	NC_013205	GC	3	6	318502	318507	0 %	0 %	50 %	50 %	258510295
6243	NC_013205	GGA	2	6	318509	318514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510295
6244	NC_013205	CCGA	2	8	318576	318583	25 %	0 %	25 %	50 %	258510295
6245	NC_013205	T	6	6	318639	318644	0 %	100 %	0 %	0 %	258510295
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6250	NC_013205	CCAT	2	8	319194	319201	25 %	25 %	0 %	50 %	258510295
6251	NC_013205	TGG	2	6	320525	320530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510296
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6267	NC_013205	GCTG	2	8	321159	321166	0 %	25 %	50 %	25 %	258510296
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6489	NC_013205	GGC	2	6	331288	331293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510300
6490	NC_013205	CGC	2	6	331310	331315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510300
6491	NC_013205	GAAT	2	8	331342	331349	50 %	25 %	25 %	0 %	258510300
6492	NC_013205	CTC	2	6	331390	331395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510300
6493	NC_013205	CGG	2	6	331425	331430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510300
6494	NC_013205	TCG	2	6	331445	331450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510300
6495	NC_013205	GC	3	6	331494	331499	0 %	0 %	50 %	50 %	258510300
6496	NC_013205	CGA	2	6	331500	331505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510300
6497	NC_013205	GAT	2	6	331582	331587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510300
6498	NC_013205	TCGA	2	8	331600	331607	25 %	25 %	25 %	25 %	258510300
6499	NC_013205	CAGC	2	8	331657	331664	25 %	0 %	25 %	50 %	258510300
6500	NC_013205	GCC	2	6	331701	331706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510300

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